与此同时，正德也终于到达的南京，而且与历史上的一样，他在得知宁王已经被捉住时，心中十分的失望，甚至还对伍文定等人有些不满，江彬等人在察觉到正德的这种心思后，竟然十分大胆的把伍文定给抓了起来，然后把宁王等俘虏也给抢了过来。
对于江彬等人的胡作非为，正德也并没有制止，不过他也有分寸，伍文定等人虽然被抓，但并不会有事，顶多是关上几天给正德解解气，日后依然会论功行赏，至于宁王这些俘虏，正德也给他们安排了一出十分有名的节目，也就是历史上的那场放了宁王，然后又把他们亲自捉住的闹剧。
正德对宁王被别人抓住的事情十分不满，因为他觉得只有自己亲自把对方抓住，才算是给自己解了气，可惜他还没到南京，宁王就已经被伍文定等人生擒了，而且俘虏也被送到了南京，在这种情况下，正德身边的一些小人竟然出了个馊主意，那就是让正德把宁王放回去，等到对方重新整合叛军后，再由正德亲自去平叛。
对于这个主意，正德虽然十分心动，但幸好他还算是有点理智，知道自己如果真的这样做的话，那么肯定会留下一个千古的大笑话，所以正德并没有完全采取这个建议，而是选择了一个影响比较小的折中办法。
当宁王等战俘被送到南京时，并没有立刻关进大牢，而是被人去除掉枷锁，又让他们骑上马拿着武器，然后送到明军的包围圈中，最后正德又带着自己的亲卫，同样披甲执锐与宁王对战，结果把宁王差点气死，他本来就不是武将，被送来南京的俘虏中也同样大部分都是文官，正德竟然要让他们拿起武器厮杀，这简直比杀了他们还要难受。
这场闹剧最后自然是以正德再次把宁王等人全部擒拿做为结束，然后这些被正德亲自抓住的“战俘”全都被送到南京的大牢之中，任何人都不许探视，不过唯独有一人例外，这个人就是朱厚照自己。
自从宁王等人被关进大牢之后，朱厚照曾经数次进入牢中，而且每次都不许任何人陪伴，甚至连江彬也不行，所以也根本没有人知道朱厚照进入大牢后干了什么，不过据后人的推测，朱厚照进入大牢应该是去见了宁王，至于他们两人都说了些什么？朱厚照是否痛骂过宁王等这些问题？那就不是后人可以猜测的了。
宁王被送到南京的当月月底，正德就命人将宁王等人在通州斩首，这个通州并不是北方的通州，而是南京旁边的通州，也就是后世俗称中的南通州，与北京旁边的北通州遥相呼应。
宁王等人被斩首后，也标志着宁王之乱被彻底平定，但是正德并没有立刻回北京，而是依然呆在南方游玩，说起来他上次为了与周重相认，曾经来过一次南方，但那次他与张太后一起，而且又有事情要办，所以来去匆匆，根本没有机会领会南方各地的风情，再加上现在北方平定，正德又因宁王之乱导致心情郁闷，所以刚好借这个机会游山玩水一番，顺便也散一散心。
也正是因为如此，所以正德在南京呆了一段时间，游遍了秦淮河两岸后，就开始四处游玩，甚至连过年也不打算回去，就这样他一直在南方呆到第二年的九月份，这天正德来到清江浦一带，并且一时兴起，准备在积水池中钓鱼，虽然两旁的侍卫苦苦相劝，但正德却执意不听，驾着一叶小船就开始钓鱼。
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